ENCODE最大的影响 这个项目最深刻的影响是它使功能鉴定社区和遗传学社区之间的接口成为可能，这是两个平行的努力。 随着ENCODE的启动，基因学界开创了一种称为全基因组关联研究 (GWAS)的方法，以发现基因组中在统计上与疾病风险相关的基因变异。