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在 ATAC-seq 和 ChIP-seq 差异分析中,拷贝数变异(CNV)常被忽视。研究人员开展了关于拷贝数归一化的研究,提出相关分析流程。结果表明该流程能分离拷贝数驱动的差异信号,在唐氏综合征研究中也有重要发现,为相关研究提供新方法。
2012年,邵振与张一婧等合作在Genome Biology发表了用于两个ChIP-seq样本之间进行一对一定量比较的MAnorm模型。 近年来,随着实验技术的发展和测序成本的不断降低,在ChIP-seq样本组(而非单个样本)之间进行比较分析已成为越来越常见的研究需求。
引言近年来,单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而,仅依赖单一的转录组信息往往 ...